S Pen là yếu tố đặc trưng của dòng Galaxy Note từ khi ra mắt năm 2011. Từ việc cải thiện độ nhạy cảm ứng lực đến tích hợp các tính năng mới của Air Command, S Pen cũng liên tục được cập nhật sau mỗi thế hệ. Năm nay, "bút phù thủy" trên Galaxy Note 9 có khả năng điều khiển từ xa nhờ công nghệ Bluetooth Low-Energy (BLE).
Samsung kết hợp công nghệ Bluetooth Low-Energy (BLE) với S Pen để biến bút stylus thành một điều khiển từ xa. BLE cần năng lượng để làm việc và pin được tích hợp vào bút stylus nhưng trải nghiệm viết vẫn phải được duy trì, cũng như việc sạc pin phải nhanh chóng, dễ dàng.
Do tính năng Bluetooth tiêu thụ mức độ điện năng khác nhau ở mỗi tác vụ, việc thiết kế S Pen trở thành một thách thức. Nếu lắp thêm một tụ điện bên trong, thiết kế đặc trưng của S Pen có thể bị phá hỏng.
Sau nhiều lần thử nghiệm, các kỹ sư Samsung quyết định phát triển một vi mạch tích hợp cho ứng dụng chuyên biệt để cung cấp các mức độ dòng điện khác nhau cho chế độ viết và sạc. Điều này cũng cho phép nút điều khiển của S Pen phát hiện được khoảng cách giữa bút so với Galaxy Note 9 và tự động chuyển từ chế độ cộng hưởng điện từ trường sang chế độ Bluetooth khi bút stylus ở xa điện thoại. Với thời lượng pin 30 phút hoặc tối đa 200 lần nhấn và khả năng sạc nhanh, S Pen có thể sử dụng gần như bất cứ khi nào cần.
S Pen mới có thể điều khiển Galaxy Note 9 trong bán kính 10m. Ngoài tính năng chụp ảnh từ xa, thuyết trình, điều khiển nhạc, video, trình chiếu ảnh "không dây", nhiều tính năng khác cũng đang được các lập trình viên phát triển khi bộ công cụ phát triển phần mềm cho S Pen vừa được ra mắt.