Sau sự cố in nhầm cờ của Indonesia, nước chủ nhà SEA Games 29 tiếp tục trở thành tâm điểm chỉ trích khi một số fan có lời lẽ xúc phạm, kích động nhằm vào tuyển U22 Singapore tại sân Shah Alam khi hai đội gặp nhau trong khuôn khổ bảng A môn bóng đá nam hôm 16/8.
Theo đó, đoạn video quay cảnh nhóm fan Malaysia hát vang câu "Chúng tôi tới Shah Alam, đoàn kết để cổ vũ Malaysia, chó Singapore sẽ bị giết" khiến những người Singapore phẫn nộ. Một CĐV còn giơ ngón tay thối hướng về phía sân trong trận đấu. Nhóm CĐV quá khích trên được cho là thành viên của hội CĐV Ultras Malaysia.
Một loạt bình luận từ phía đất nước láng giềng đều bày tỏ sự không hài lòng, nhấn mạnh rằng fan Malaysia thiếu tinh thần thể thao và đạo đức. Một số CĐV Malaysia sau đó gửi lời xin lỗi tới người dân Singapore, đồng thời cho biết đoạn video không đại diện cho số đông người Malaysia.
Đại diện ban tổ chức SEA Games cũng lên tiếng lấy làm tiếc vì sự cố, đồng thời kêu gọi các CĐV thể hiện tinh thần hiếu khách, thân thiện, không phát ngôn phân biệt chủng tộc hay xúc phạm CĐV nước khác.
Sau ba lượt trận tại bảng A, U22 Malaysia đang xếp thứ hai sau U22 Myanmar, cùng có 9 điểm nhưng thua hiệu số. Trong khi đó, U22 Singapore mới chỉ có 3 điểm và sớm bị loại. Trong trận đấu với Malaysia hôm 16/8, tuyển Singapore để thua 1-2.