Sáng 11/4, tại trụ sở LĐBĐ Việt Nam diễn ra lễ bốc thăm chia bảng giải hạng Nhì quốc gia 2019. Giải năm nay có 14 đội bóng tranh tài gồm Nam Định, Kon Tum, Lâm Đồng, Khánh Hòa, Bình Thuận, Bà Rịa - Vũng Tàu, Tiền Giang, Bến Tre, Long An, Vĩnh Long, Trẻ Hà Nội, Trẻ Đà Nẵng, Gia Định và Công an Nhân dân.
Ban tổ chức tiến hành chia bảng căn cứ vào khu vực địa lý nhằm giảm thiểu chi phí cho các đội. Bảng A gồm Công an Nhân dân, Trẻ Hà Nội, Nam Định, Trẻ Đà Nẵng, Kon Tum, Lâm Đồng và Khánh Hòa. Bảng B gồm Bình Thuận, Gia Định, Bà Rịa - Vũng Tàu, Long An, Tiền Giang, Bến Tre và Vĩnh Long.
Các đội đá vòng tròn theo thể thức lượt đi và lượt về (sân khách và sân nhà) để tính điểm, xếp hạng. Hai đội có thứ hạng cao nhất tại mỗi bảng tham dự vòng chung kết. Đội có điểm, chỉ số phụ thấp nhất trong hai bảng xuống hạng.
Tại vòng chung kết, 4 đội được chia thành hai cặp đấu bán kết (nhất bảng A gặp nhì bảng B và nhất bảng B gặp nhì bảng A). Hai đội thắng bán kết tiếp tục gặp nhau trong trận chung kết. Các trận đấu ở vòng chung kết thi đấu theo thể thức loại trực tiếp một trận, nếu sau thời gian thi đấu chính thức (90 phút) tỷ số hòa, hai đội đá luân lưu để xác định đội thắng.
Đội thắng trận chung kết giành suất thăng hạng duy nhất lên thi đấu tại giải hạng Nhất quốc gia 2020. Theo lịch của ban tổ chức, lượt đi vòng bảng diễn ra từ 1/5-10/6, lượt về từ 10/7-9/8. Vòng chung kết diễn ra từ ngày 16-19/8.